配置方面：域名和服务器。
网站开发需要一个域名和服务器，并且域名是网站的重要入口，所以，有的公司会花大价钱去购买域名，或者好的服务器。小程序呈现上看，似乎不需要域名。其实，小程序也是需要域名的，不过，域名不重要和不呈现，同样，小程序也需要购买服务器。
类型方面：展示型、交易型
从功能上看，网站可以大致分为展示型、营销型、交易商城（交易型）几种。而小程序，根据功能划分，也可以分为展示型、交易型（小程序商城）。
制作方面：外包、自建、模板
如果客户想要制作网站，在工作方式方面，有几种不同的选择，可以选择自己组建团队，自己设计和运营；也可以选择外包给建站公司；还可以选择模板建站系统，购买系统自助建站。上线小程序也是一样，可以外包给设计公司，也可以自己组建团队，还可以购买有赞这样的模板开发商。
功能方面：承载内容和功能多少不同
目前的建站技术，可以让网站呈现大量的内容和功能。即便如社交平台这样复杂的功能、如游戏这样大的容量，网站也是可以承载的，并且借助分布式的构架，可以让用户获得良好的使用体验。但是，小程序则不然。一个小程序承载内容是有限的，承载的功能也较为单一，应该避免单个小程序承载过重的功能。
审核权方面：自主权利大小有别
做网站，受到的限制是比较少的，网站的内容、服务审核权，都在网站所有者手中。甚至，一些灰色的行业和公司，只要通过域名备案，也能够借助网站宣传业务。但是，小程序审核就比较严格，代码需要提交平台审核，内容和产品也会被平台巡查，所有者的权限是收到约束的。
价格方面：不同类型差异较大
总体上看，同类型的网站和小程序，小程序的开发费用要低于网站。一方面是小程序的功能较为单一、布局较为规整、增值功能无法接入，所以，价格便宜。而网站可能需要优化代码、增加更多功能、需要后台程序、需要建立数据库，导致开发成本高企。
